miniJSRT_database

miniJSRT_databaseは,医用画像に関する深層学習の研究を始めてみようという初学者の方のために作成されました.
本データベースは,日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」をもとに画像加工を施し作成されています.オリジナル画像に関する情報は,以下のURLを参照してください.

http://db.jsrt.or.jp/eng.php
利用にあたっては以下の点にご注意ください.

  • 商用を目的とした製品のパフォーマンステストやベンチマークテストなどの目的でのご利用はおすすめしません.
  • miniJSRT_database内には,信頼性が低いアノテーションデータも含まれます.実際の業務や臨床的有効性の評価などを目的としたご利用はおすすめしません.
  • 本データベースのご利用にあたり論文の引用は以下のとおりです.
    [1] Shiraishi J, Katsuragawa S, Ikezoe J, Matsumoto T, Kobayashi T, Komatsu K, Matsui M, Fujita H, Kodera Y, and Doi K.: Development of a digital image database for chest radiographs with and without a lung nodule: Receiver operating characteristic analysis of radiologists’ detection of pulmonary nodules. AJR 174; 71-74, 2000

    ■練習用
    >Practice1 練習用データセット1(pngとjpg形式)
    説明:
    画像はマトリックスサイズ2048×2048のpngとjpegファイル形式です.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている10画像が,それぞれの形式で本データセット内に収録されています.ファイルを入出力など基本的な動作の練習用にご利用ください.
    ダウンロード(2048×2048,Gray:8bit):
    練習用データベース1
    >Practice2 練習用データセット2(DICOM形式)
    説明:
    画像はマトリックスサイズ2048×2048のDICOMファイル形式です.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている10画像が,DICOM形式で本データセット内に収録されています.ファイルを入出力など基本的な動作の練習用にご利用ください.
    ダウンロード(2048×2048,dicom):
    練習用データベース2
    ■Classification
    >Directions01 胸部X線画像の画像方向(Up/Down/Left/Rightの4クラス分類)
    説明:
    画像はマトリックスサイズ128×128のpngファイル形式です.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている247画像において,1画像につき0°(Up),90°(Right),180°(Down),270°(Left)回転させています.本データセット内には247×4=988枚の画像が収録されています.各方向の247枚の画像について237画像を学習用,10画像を評価用としてフォルダに分け,train,test用フォルダは,Up,Down,Right,Leftの4つのフォルダで構成されています.
    画像例:
    ダウンロード(128×128,Gray:8bit):
    Directions01
    ダウンロード(128×128,RGB Color:24bit):
    Directions01(RGB)
    ダウンロード(128×128,Index Color:8bit):
    Directions01(Index)
    >Gender01 胸部X線画像の性別分類(male/femaleの2クラス分類)
    説明:
    画像はマトリックスサイズ256×256のpngファイル形式です.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている247画像において,性別による分類を行ったデータセットです.trainフォルダ内のmaleフォルダには68画像,femaleフォルダ内には86画像,testフォルダ内のmaleフォルダには51画像,femaleフォルダには42画像が収録されています.
    画像例:
    ダウンロード(256×256,Gray:8bit):
    Gender01
    ダウンロード(256×256,RGB Color:24bit):
    Gender01(RGB)
    ダウンロード(256×256,Index Color:8bit):
    Gender01(Index)
    ■Segmentation
    >Segmentation01 胸部X線画像の肺野領域抽出(肺野領域:255/肺野外:0)
    説明:
    胸部X線画像はpngファイル形式です.
    ラベル画像(教師画像)は,肺野領域を画素値255,画素値0とした画像で,pngファイル形式で収録されています.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている60枚の画像を使用しています.org_trainフォルダ内には学習用画像50枚,label_trainフォルダ内には学習用ラベル画像50枚,org_testフォルダ内には評価用画像10枚,label_testフォルダ内には評価用ラベル画像10枚が収録されています.
    ※ラベルデータの肺野領域の定義・決定については,医学的監修を受けていないため,医学的な根拠は一切ありません.
    画像例:
    ダウンロード(256×256, Gray:8bit):
    Segmentation01
    ダウンロード(256×256,RGB Color:24bit):
    Segmentation01(RGB)
    ダウンロード(256×256,Index Color:8bit):
    Segmentation01(Index)
    ダウンロード(64×64, Gray:8bit):
    Segmentation01_small
    ダウンロード(64×64, RGB Color:24bit):
    Segmentation01_small(RGB)
    ダウンロード(64×64, Index Color:8bit):
    Segmentation01_small(Index)
    >Segmentation02 胸部X線画像の肺野領域抽出(肺野領域:255/心臓:85/肺野外:170/体外:0)
    説明:
    胸部X線画像はbmpファイル形式です.
    ラベル画像(教師画像)は,肺野領域を画素値255,心臓領域を85,肺野外を170,体外を0とした画像で,pngファイル形式で収録されています.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている247枚の画像を使用しています.org_trainフォルダ内には学習用画像199枚,label_trainフォルダ内には学習用ラベル画像199枚,org_testフォルダ内には評価用画像48枚,label_testフォルダ内には評価用ラベル画像48枚が収録されています.それぞれ_sの添え字のフォルダは,画像枚数が24枚のデータセットとなります.
    ※ラベルデータの肺野領域の定義・決定については,医学的監修を受けていないため,医学的な根拠は一切ありません.
    ダウンロード(256×256):
    Segmentation02
    ■Regression
    >Age01 年齢推定(回帰)
    説明:
    画像はマトリックスサイズ2048×2048のjpeg(RGB 24bit)ファイル形式です.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている247枚の画像を使用しています.アノテーションデータとして画像ファイル名と年齢をCSVファイル形式で収録しています.
    ダウンロード(2048×2048,RGB:24bit):
    XPAge01_RGB
    ■SuperResolution
    >SuperResolution01 疑似低解像画像からの復元
    説明:
    画像はマトリックスサイズ256×256のpngファイル形式です.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている247枚の画像を使用しています.低解像画像は256×256に縮小された胸部X線画像を,幅と高さを1/3サイズに平均画素法で縮小し,その後,元の256×256にバイキュービック補間(4×4 近傍領域)で拡大した画像となります.
    ※低解像画像は,画像加工により意図的に作成された疑似的な低解像画像です.本来の超解像や高解像化を確認できるものではありません.
    画像例:
    ダウンロード(256×256,Gray:8bit):
    SuperResolution01
    ダウンロード(256×256,RGB Color:24bit):
    SuperResolution01(RGB)
    ダウンロード(256×256,Index Color:8bit):
    SuperResolution01(Index)
    ■Denoise
    >Denoise01 ノイズ低減処理
    説明:
    画像はマトリックスサイズ256×256のpngファイル形式です.
    日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている学習用197枚と評価用50枚にあらかじめ分割してあります.ノイズ付加画像は,画像加工により人工的なノイズを付加した画像で,正規分布に従う平均0, 標準偏差50のノイズを加算した画像となります.
    ダウンロード(256×256,RGB:24bit):
    Denoise01
    ■AutoEncoder
    >AutoEncoder01 左右反転検出の教師なし学習
    説明:
    画像はマトリックスサイズ256×256のpngファイル形式です.
    画像は256×256のpngファイル形式と左右反転像はtif形式です.日本放射線技術学会の「標準ディジタル画像データベース[胸部腫瘤陰影像]」に収録されている画像から17例を左右反転して異常像を作っています.左右反転像はflipフォルダーに保存されています.正常方向の画像は,normal200とnormalに分けて保存しています.
    ダウンロード(256×256,RGB:24bit):
    AutoEncoder01